" Le temps est détraqué. Oui, maudite rancune... Je suis né pour le remettre en place ! "
Une jeune fille assassinée ; une mage bloquée sur une île ; Une histoire de vengeance, mais qui contrairement à l'oeuvre de Shakespeare qu'est Hamlet, ne se termine pas en tragédie ; ceci est une autre de celui-ci, qui est : La Tempête.
Aika Fuwa, la soeur de Mahiro Fuwa, a été assassinée. Le meurtrier n'a toujours pas été retrouvé. Une année passe, Mahiro a disparu depuis un moment déjà... Son ami d'enfance : Yoshino Takigawa se retrouvait seul, a affronté les nombreuses interrogations au sujet du disparu. Un jour. Ce jour en était un bien particulier. Une femme se présente à Yoshino, alors que celui-ci se recueillait sur la tombe des Fuwa, c'était cette rencontre qui marquait le retour de Mahiro, portant secours à son ami. Des vérités ont fait leurs arrivées : La magie et les mages ; la maladie du fer ; les fruits de l'exode, en claire la destruction de la civilisation. Et d'Hakaze, la mage bloquée sur une île, parlant avec Mahiro avec un talisman. Tous deux se sont passés un accord : Mahiro aide Hakaze à sauver le monde, si elle l'aide a retrouver l'assassin d'Aika. C'est une bataille entre l'Arbre de la Genèse et l'Arbre de l'Exode qui commence... ou plutôt recommence...
Zetsuen no Tempest ~ The Civilization Blaster rend un hommage à l'oeuvre de William Shakespeare via des dialogues et des éléments du contexte de l'histoire.